From 23b750bd78261442ae22b2ec940830725e20e497 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Thu, 21 Nov 2019 11:58:28 +0100
Subject: [PATCH 01/11] Avoid MPI.Barrier when no needed

---
 hermesv3_gr/config/config.py               | 9 +++------
 hermesv3_gr/modules/grids/grid.py          | 7 +++----
 hermesv3_gr/modules/grids/grid_global.py   | 1 -
 hermesv3_gr/modules/grids/grid_latlon.py   | 1 -
 hermesv3_gr/modules/grids/grid_lcc.py      | 4 +---
 hermesv3_gr/modules/grids/grid_mercator.py | 3 ---
 hermesv3_gr/modules/grids/grid_rotated.py  | 2 --
 hermesv3_gr/modules/regrid/regrid.py       | 1 -
 8 files changed, 7 insertions(+), 21 deletions(-)

diff --git a/hermesv3_gr/config/config.py b/hermesv3_gr/config/config.py
index 7775770..a172616 100755
--- a/hermesv3_gr/config/config.py
+++ b/hermesv3_gr/config/config.py
@@ -235,14 +235,11 @@ class Config(ArgParser):
         """
         import os
         from mpi4py import MPI
-        comm = self.comm.Split(color=0, key=0)
-        rank = comm.Get_rank()
 
-        if rank == 0:
-            if not os.path.exists(path):
+        if not os.path.exists(path):
+            if self.comm.Get_rank() == 0:
                 os.makedirs(path)
-
-        comm.Barrier()
+            self.comm.Barrier()
 
     @staticmethod
     def _parse_bool(str_bool):
diff --git a/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py b/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py
index a66f21f..d604ce5 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py
@@ -423,10 +423,10 @@ class Grid(object):
         else:
             self.shapefile_path = os.path.join(self.temporal_path, 'shapefiles_n{0}'.format(settings.size))
 
-        if settings.rank == 0:
-            if not os.path.exists(self.shapefile_path):
+        if not os.path.exists(self.shapefile_path):
+            if settings.rank == 0:
                 os.makedirs(self.shapefile_path)
-        settings.comm.Barrier()
+            settings.comm.Barrier()
         if full_grid:
             self.shapefile_path = os.path.join(self.shapefile_path, 'grid_shapefile.shp')
         else:
@@ -505,7 +505,6 @@ class Grid(object):
             settings.write_log('\t\tGrid shapefile already done. Lets try to read it.', level=3)
             gdf = gpd.read_file(self.shapefile_path)
 
-        settings.comm.Barrier()
         settings.write_time('Grid', 'to_shapefile', timeit.default_timer() - st_time, level=1)
 
         return gdf
diff --git a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_global.py b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_global.py
index 2f63c3c..ecdfcf7 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_global.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_global.py
@@ -79,7 +79,6 @@ class GlobalGrid(Grid):
 
         self.shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), self.x_upper_bound-self.x_lower_bound,
                       self.y_upper_bound-self.y_lower_bound)
-        settings.comm.Barrier()
 
         total_area = self.get_cell_area()
         self.full_shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), total_area.shape[-2], total_area.shape[-1])
diff --git a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_latlon.py b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_latlon.py
index df0a676..bc21296 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_latlon.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_latlon.py
@@ -90,7 +90,6 @@ class LatLonGrid(Grid):
 
         self.shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), self.x_upper_bound-self.x_lower_bound,
                       self.y_upper_bound-self.y_lower_bound)
-        settings.comm.Barrier()
 
         total_area = self.get_cell_area()
         self.full_shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), total_area.shape[-2], total_area.shape[-1])
diff --git a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_lcc.py b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_lcc.py
index 42aaebc..f672d22 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_lcc.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_lcc.py
@@ -116,9 +116,7 @@ class LccGrid(Grid):
 
         self.shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), self.x_upper_bound-self.x_lower_bound,
                       self.y_upper_bound-self.y_lower_bound)
-        # print 'Rank {0} _3_\n'.format(settings.rank)
-        settings.comm.Barrier()
-        # print 'Rank {0} _4_\n'.format(settings.rank)
+
         total_area = self.get_cell_area()
         self.full_shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), total_area.shape[-2], total_area.shape[-1])
         self.cell_area = total_area[self.x_lower_bound:self.x_upper_bound, self.y_lower_bound:self.y_upper_bound]
diff --git a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_mercator.py b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_mercator.py
index d18c32d..e956d17 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_mercator.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_mercator.py
@@ -105,9 +105,6 @@ class MercatorGrid(Grid):
         self.shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), self.x_upper_bound-self.x_lower_bound,
                       self.y_upper_bound-self.y_lower_bound)
 
-        # print 'Rank {0} _3_\n'.format(settings.rank)
-        settings.comm.Barrier()
-        # print 'Rank {0} _4_\n'.format(settings.rank)
         total_area = self.get_cell_area()
         self.full_shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), total_area.shape[-2], total_area.shape[-1])
         self.cell_area = total_area[self.x_lower_bound:self.x_upper_bound, self.y_lower_bound:self.y_upper_bound]
diff --git a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_rotated.py b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_rotated.py
index 8c99036..97d89be 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/grids/grid_rotated.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/grids/grid_rotated.py
@@ -77,8 +77,6 @@ class RotatedGrid(Grid):
         self.shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), self.x_upper_bound-self.x_lower_bound,
                       self.y_upper_bound-self.y_lower_bound)
 
-        settings.comm.Barrier()
-
         total_area = self.get_cell_area()
         self.full_shape = (timestep_num, len(self.vertical_description), total_area.shape[-2], total_area.shape[-1])
         self.cell_area = total_area[self.x_lower_bound:self.x_upper_bound, self.y_lower_bound:self.y_upper_bound]
diff --git a/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid.py b/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid.py
index 9d224a9..1302a9d 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid.py
@@ -37,7 +37,6 @@ class Regrid(object):
         if not self.is_created_weight_matrix(erase=False):
             settings.write_log("\t\t\tWeight matrix {0} is not created. ".format(weight_matrix_file) +
                                "Trying to create it", level=1)
-            settings.comm.Barrier()
             self.create_weight_matrix()
 
         settings.write_time('Regrid', 'Init', round(timeit.default_timer() - st_time), level=3)
-- 
GitLab


From 43ea7e59dd4bd9d33b2ca236f18ac14d956f7c70 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Thu, 21 Nov 2019 14:49:47 +0100
Subject: [PATCH 02/11] Added option to do not fail when find unrecognized
 arguments

---
 hermesv3_gr/config/config.py | 7 +++++--
 1 file changed, 5 insertions(+), 2 deletions(-)

diff --git a/hermesv3_gr/config/config.py b/hermesv3_gr/config/config.py
index a172616..6cb466a 100755
--- a/hermesv3_gr/config/config.py
+++ b/hermesv3_gr/config/config.py
@@ -19,7 +19,7 @@
 
 
 from configargparse import ArgParser
-import sys
+from warnings import warn
 import os
 from shutil import rmtree
 from mpi4py import MPI
@@ -168,7 +168,10 @@ class Config(ArgParser):
         p.add_argument('--world_info', required=True,
                        help='Path to the file that contains the world information like timezones, ISO codes, ...')
 
-        arguments = p.parse_args()
+        arguments, unknown = p.parse_known_args()
+        if len(unknown) > 0:
+            warn("Unrecognized arguments: {0}".format(unknown))
+
         for item in vars(arguments):
             is_str = isinstance(arguments.__dict__[item], str)
             if is_str:
-- 
GitLab


From a0c3dc721de4489445357eaf43b6aeff1dde7774 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Thu, 21 Nov 2019 15:22:07 +0100
Subject: [PATCH 03/11] WIP

---
 .gitignore | 3 +++
 CHANGELOG  | 5 +++++
 2 files changed, 8 insertions(+)

diff --git a/.gitignore b/.gitignore
index c10666e..d23a377 100755
--- a/.gitignore
+++ b/.gitignore
@@ -1,2 +1,5 @@
 .idea
 *.pyc
+dist
+build
+hermesv3_gr.egg*
\ No newline at end of file
diff --git a/CHANGELOG b/CHANGELOG
index fdfe3ac..e1e63d4 100755
--- a/CHANGELOG
+++ b/CHANGELOG
@@ -1,3 +1,8 @@
+2.0.1
+    XXXX
+    - Added unrecognized arguments
+    - Drop some MPI Barriers
+
 2.0.0
     2019/11/20
     - Python 3
-- 
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From 398ce1300d737e5670727b80d519ed9c990fe4d5 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Thu, 5 Dec 2019 10:22:03 +0100
Subject: [PATCH 04/11] Drop unuser library from dependencies

---
 setup.py | 1 -
 1 file changed, 1 deletion(-)

diff --git a/setup.py b/setup.py
index 2050aed..fab8b0c 100755
--- a/setup.py
+++ b/setup.py
@@ -60,7 +60,6 @@ setup(
         'pytz',
         'timezonefinder>=4.0.0',
         'mpi4py',
-        'pytest',
     ],
     packages=find_packages(),
     classifiers=[
-- 
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From 69cd772b5f5e80acea9a413e71bfd25e1df22869 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: mguevara <marc.guevara@bsc.es>
Date: Tue, 10 Dec 2019 11:57:35 +0100
Subject: [PATCH 05/11] Updated specitation profiles for MONARCH Cb05 AERO5,
 added GFAS species

---
 .../Speciation_profile_cb05_aero5_MONARCH.csv | 252 +++++++++++-------
 1 file changed, 154 insertions(+), 98 deletions(-)

diff --git a/data/profiles/speciation/Speciation_profile_cb05_aero5_MONARCH.csv b/data/profiles/speciation/Speciation_profile_cb05_aero5_MONARCH.csv
index d6660a5..4680845 100755
--- a/data/profiles/speciation/Speciation_profile_cb05_aero5_MONARCH.csv
+++ b/data/profiles/speciation/Speciation_profile_cb05_aero5_MONARCH.csv
@@ -1,98 +1,154 @@
-ID;NO;NO2;HONO;CO;SO2;NH3;ALD2;ALDX;BENZENE;ETH;ETHA;ETOH;FORM;IOLE;ISOP;MEOH;OLE;PAR;SESQ;TERP;TOL;XYL;DMS;HCL;POA;PEC;PNO3;PSO4;PMFINE;PMC
-units;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;mol.s-1.m-2;kg.s-1.m-2;kg.s-1.m-2;kg.s-1.m-2;kg.s-1.m-2;kg.s-1.m-2;kg.s-1.m-2
-short_description;nitrogen_monoxide;nitrogen_dioxide;nitrous_acid;carbon_monoxide;sulfur_dioxide;ammonia;acetaldehyde;higher_aldehydes;benzene;ethene;ethane;ethanol;formaldehyde;internal_olefin_carbon_bond;isoprene;methanol;terminal_olefin_carbon_bond;paraffin_carbon_bond;sesquiterpenes;terpene;toluene;xylene;dimethyl_sulfide;hydrogen_chloride;primary_organic_carbon;primary_elemental_carbon;primary_nitrate_fine;primary_sulfate_fine;primary_others_fine;pm_coarse
-E001;0.72*nox_no;0.18*nox_no;0.1*nox_no;co;so2;nh3;c2h4o;0;c6h6;c2h4;c2h6;c2h5oh;0;0.5*hialkenes;c5h8;ch3oh;c8h16+c5h10+c3h6+c4h8+c6h12+0.5*hialkanes;4*c4h10+6*c6h14+5*hialkanes+6*c8h16+3*c5h10+c3h6+3*c3h6o+2*c4h8+7*c7h16+4*c6h12+hialkenes+5*c5h12+1.5*c3h8;0;terpenes;ch2o+c7h8;c8h10;c2h6s;0;oc;bc;0;0;3.3*pm25-3*oc-5.9*bc;0
-E002;0.9*nox_no2;0.1*nox_no2;0;co;so2;nh3;0.625*voc22;0.375*voc22;voc13;voc07;voc02;0.5*voc01;voc21;0.666*voc12;0;0.5*voc01;voc08+0.333*voc12;1.5*voc03+4*voc04+5*voc05+7.5*voc06+voc08+voc09+voc13+voc16+2.2*voc17+1.875*voc22+4*voc23+voc24;0;0;voc14+0.2*voc17;voc15+voc16+voc17;0;0;1.3*oc;bc;0;(pm25-oc-bc)*0.155;(pm25-oc-bc)*0.845;pm10-pm25
-E003;0.9*nox_no2;0.1*nox_no2;0;co;so2;nh3;0.625*voc22;0.01*voc18+0.3*voc19+0.375*voc22;voc13;voc07;voc02;0.5*voc01;voc21;0.666*voc12;0;0.5*voc01;voc08+0.333*voc12;1.5*voc03+4*voc04+5*voc05+7.5*voc06+voc08+voc09+voc13+voc16+2.2*voc17+4.11*voc18+4*voc19+1.875*voc22+4*voc23+voc24;0;0;voc14+0.2*voc17;voc15+voc16+voc17;0;0;1.3*oc;bc;0;(pm25-oc-bc)*0.089;(pm25-oc-bc)*0.911;pm10-pm25
-E004;0.9*nox_no2;0.1*nox_no2;0;co;so2;nh3;0.625*voc22;0.3*voc19+0.375*voc22;voc13;voc07;voc02;0.5*voc01;voc21;0.666*voc12;0;0.5*voc01;voc08+0.333*voc12;1.5*voc03+4*voc04+5*voc05+7.5*voc06+voc08+voc09+voc13+voc16+2.2*voc17+4*voc19+1.875*voc22+4*voc23+voc24;0;0;voc14+0.2*voc17;voc15+voc16+voc17;0;0;1.8*oc;bc;0;(pm25-oc-bc)*0.047;(pm25-oc-bc)*0.953;pm10-pm25
-E005;0.823*nox_no2;0.16*nox_no2;0.017*nox_no2;co;so2;nh3;0.625*voc22;0.375*voc22;voc13;voc07;voc02;0;voc21;0.666*voc12;0;0;voc08+0.333*voc12;1.5*voc03+4*voc04+5*voc05+7.5*voc06+voc08+voc09+voc13+voc16+2.2*voc17+1.875*voc22+4*voc23;0;0;voc14+0.2*voc17;voc15+voc16+voc17;0;0;1.3*oc;bc;0;(pm25-oc-bc)*0.059;(pm25-oc-bc)*0.941;pm10-pm25
-E006;0;0;0;0;0;nh3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0
-E007;0.9*nox_no2;0.1*nox_no2;0;co;so2;0;0.625*voc22;0.375*voc22;voc13;voc07;voc02;0;voc21;0.666*voc12;0;0;voc08+0.333*voc12;1.5*voc03+5*voc05+7.5*voc06+voc08+voc09+voc13+2.2*voc17+1.875*voc22+4*voc23;0;0;voc14+0.2*voc17;voc15+voc17;0;0;1.3*oc;bc;0;0;pm25-oc-bc;pm10-pm25
-E008;0.9*nox_no2;0.1*nox_no2;0;co;so2;0;0.625*voc22;0.01*voc18+0.3*voc19+0.375*voc22;voc13;voc07;voc02;0.5*voc01;voc21;0.666*voc12;0;0.5*voc01;voc08+0.333*voc12;1.5*voc03+4*voc04+5*voc05+7.5*voc06+voc08+voc09+voc13+voc16+2.2*voc17+4.11*voc18+4*voc19+1.875*voc22+4*voc23+voc24;0;0;voc14+0.2*voc17;voc15+voc16+voc17;0;0;1.3*oc;bc;0;(pm25-oc-bc)*0.537;(pm25-oc-bc)*0.463;pm10-pm25
-E009;0.9*nox_no;0.1*nox_no;0;co;so2;nh3;0;0;c6h6;c2h4;0;0;0;0;0;ch3oh;c3h6;c2h2+c3h6+ch3cooh;0;0;ch2o;0;0;hcl;1.44*oc;bc;0;0;pm25-oc-bc;pm10-pm25
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\ No newline at end of file
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GitLab


From 4673ceeeeeb8b6d3d7232c8f7af454b957c60509 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Wed, 11 Dec 2019 15:15:36 +0100
Subject: [PATCH 06/11] Changed ; by , in the vertical profiles

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\ No newline at end of file
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+2,88
+3,145
+4,226
+5,324
+6,456
+7,623
+8,819
+9,1044
+10,1319
+11,1657
+12,2074
+13,2582
+14,3215
+15,3848
+16,4489
+17,5122
+18,5742
+19,6374
+20,6987
+21,7609
+22,8223
+23,8843
+24,9469
+25,10078
+26,10689
+27,11300
+28,11939
+29,12580
+30,13218
+31,13971
+32,14779
+33,15599
+34,16616
+35,17604
+36,18685
+37,18870
diff --git a/data/profiles/vertical/CMAQ_37layers_vertical_description_9layers.csv b/data/profiles/vertical/CMAQ_37layers_vertical_description_9layers.csv
index 7f83db5..1dbf0e8 100644
--- a/data/profiles/vertical/CMAQ_37layers_vertical_description_9layers.csv
+++ b/data/profiles/vertical/CMAQ_37layers_vertical_description_9layers.csv
@@ -1,10 +1,10 @@
-Ilayer;height_magl
-1;40
-2;88
-3;145
-4;226
-5;324
-6;456
-7;623
-8;819
-9;18870
+Ilayer,height_magl
+1,40
+2,88
+3,145
+4,226
+5,324
+6,456
+7,623
+8,819
+9,18870
diff --git a/hermesv3_gr/modules/vertical/vertical.py b/hermesv3_gr/modules/vertical/vertical.py
index 34baa1a..de446ac 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/vertical/vertical.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/vertical/vertical.py
@@ -106,7 +106,7 @@ class VerticalDistribution(object):
         st_time = timeit.default_timer()
         settings.write_log('Calculating vertical levels from {0} .'.format(path))
 
-        df = pd.read_csv(path, sep=';')
+        df = pd.read_csv(path)
 
         heights = df.height_magl.values
 
-- 
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From 5c9a101061551742e2d914e845c70d91bbcbbb82 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Wed, 11 Dec 2019 15:34:23 +0100
Subject: [PATCH 07/11] ; by ,

---
 hermesv3_gr/modules/grids/grid.py | 2 +-
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)

diff --git a/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py b/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py
index d604ce5..7fe4bd5 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/grids/grid.py
@@ -246,7 +246,7 @@ class Grid(object):
         st_time = timeit.default_timer()
         settings.write_log('\t\tSetting vertical levels', level=3)
 
-        df = pd.read_csv(vertical_description_path, sep=';')
+        df = pd.read_csv(vertical_description_path)
 
         heights = df.height_magl.values
 
-- 
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From 0f69b29087cf64512d5d5d45324cb1a70882521f Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Wed, 11 Dec 2019 17:20:24 +0100
Subject: [PATCH 08/11] Solved bug on rotated domain creation

---
 hermesv3_gr/tools/coordinates_tools.py | 4 ++--
 1 file changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)

diff --git a/hermesv3_gr/tools/coordinates_tools.py b/hermesv3_gr/tools/coordinates_tools.py
index 00baa67..ab54ab3 100755
--- a/hermesv3_gr/tools/coordinates_tools.py
+++ b/hermesv3_gr/tools/coordinates_tools.py
@@ -283,8 +283,8 @@ def create_regular_rotated(lat_origin, lon_origin, lat_inc, lon_inc, n_lat, n_lo
     """
     import numpy as np
 
-    center_latitudes = np.linspace(lat_origin, lat_origin + (n_lat * (lat_inc - 1)), n_lat, dtype=np.float)
-    center_longitudes = np.linspace(lon_origin, lon_origin + (n_lon * (lon_inc - 1)), n_lon, dtype=np.float)
+    center_latitudes = np.linspace(lat_origin, lat_origin + (lat_inc * (n_lat - 1)), n_lat, dtype=np.float)
+    center_longitudes = np.linspace(lon_origin, lon_origin + (lon_inc * (n_lon - 1)), n_lon, dtype=np.float)
 
     corner_latitudes = create_bounds_esmpy(center_latitudes)
     corner_longitudes = create_bounds_esmpy(center_longitudes)
-- 
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From e513c789a21c0f2fd19d1af6719a3b28120d850c Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Wed, 18 Dec 2019 11:37:26 +0100
Subject: [PATCH 09/11] Corrected bug on weight matrix creation for non global
 domains

---
 hermesv3_gr/modules/regrid/regrid_conservative.py | 4 +++-
 1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)

diff --git a/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid_conservative.py b/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid_conservative.py
index 74c219e..d75850a 100755
--- a/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid_conservative.py
+++ b/hermesv3_gr/modules/regrid/regrid_conservative.py
@@ -47,9 +47,11 @@ class ConservativeRegrid(Regrid):
         src_field = ESMF.Field(src_grid, name='my input field')
         src_field.read(filename=self.pollutant_dicts[0]['path'], variable=self.pollutant_dicts[0]['name'],
                        timeslice=0)
+        dst_grid = self.grid.create_esmf_grid_from_file(self.grid.coords_netcdf_file,
+                                                        sphere=self.grid.grid_type == 'global')
 
-        dst_grid = self.grid.create_esmf_grid_from_file(self.grid.coords_netcdf_file)
         dst_field = ESMF.Field(dst_grid, name='my outut field')
+
         ESMF.Regrid(src_field, dst_field, filename=self.weight_matrix_file, regrid_method=ESMF.RegridMethod.CONSERVE,)
 
         settings.write_time('ConservativeRegrid', 'create_weight_matrix', timeit.default_timer() - st_time, level=1)
-- 
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From 42be8c7d17367506b31088aafbd34023f279f79e Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Wed, 18 Dec 2019 11:51:49 +0100
Subject: [PATCH 10/11] Doing release 2.0.1

---
 CHANGELOG               | 3 ++-
 hermesv3_gr/__init__.py | 2 +-
 2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)

diff --git a/CHANGELOG b/CHANGELOG
index e1e63d4..d2aaaf1 100755
--- a/CHANGELOG
+++ b/CHANGELOG
@@ -1,7 +1,8 @@
 2.0.1
-    XXXX
+    2019/12/18
     - Added unrecognized arguments
     - Drop some MPI Barriers
+    - Solved bug on 2.0.0 on the creation of the weight matrix for non global domains
 
 2.0.0
     2019/11/20
diff --git a/hermesv3_gr/__init__.py b/hermesv3_gr/__init__.py
index 8c0d5d5..159d48b 100755
--- a/hermesv3_gr/__init__.py
+++ b/hermesv3_gr/__init__.py
@@ -1 +1 @@
-__version__ = "2.0.0"
+__version__ = "2.0.1"
-- 
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From 78d711716067b3fc15ec1940a2186f87b1da55c6 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Carles Tena <carles.tena@bsc.es>
Date: Wed, 18 Dec 2019 12:00:52 +0100
Subject: [PATCH 11/11] Doing release 2.0.1

---
 CHANGELOG | 2 ++
 1 file changed, 2 insertions(+)

diff --git a/CHANGELOG b/CHANGELOG
index d2aaaf1..d759bf9 100755
--- a/CHANGELOG
+++ b/CHANGELOG
@@ -2,6 +2,8 @@
     2019/12/18
     - Added unrecognized arguments
     - Drop some MPI Barriers
+    - Changed vertical description from ";" to ","
+    - Solved bug on 2.0.0 on the creation of rotated grids
     - Solved bug on 2.0.0 on the creation of the weight matrix for non global domains
 
 2.0.0
-- 
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